Tahun 2001, ia ditunjuk oleh Abdurrahman Wahid sebagai Menteri Kehakiman dan Hak Asasi Manusia.
Dia juga pernah menjadi Ketua MK pada periode 2008-2013.
Nama Mahfud juga sempat menjadi calon kuat Presiden Jokowi yang hendak maju pada periode kedua dalam Pemilu 2019.
Namun, nama Mahfud mendadak batal dipilih.
Mahfud yang ketika itu sudah mengenakan seragam putih hitam akhirnya kembali pulang setelah sempat menunggu di sebuah restoran.
(Kompas.com/ Ardito Ramadhan, Nicholas Ryan Aditya, Diamanty Meiliana/ Krisiandi)